低温技术安徽省重点实验室实行主任负责制。设实验室主任1人、常务副主任1人、副主任3人。实验室主任全面负责重点实验室的建设和运行工作，组织召开重点实验室年度工作会议，做重点实验室的工作总结，并组织制定下一年度工作计划，定期召开重点实验室室务会，听取、协调和决策实验室重大事项。

    实验室设独立学术委员会，学术委员会设主任1人，委员10人，每届任期5年。作为实验室学术指导机构，主要职责是审议实验室目标、任务和研究方向，审议实验室的重大学术活动、年度工作。